Гидроксипролин относится к заменимым аминокислотам. Максимальная концентрация гидроксипролина и пролина отмечена в коже, связках, хрящах, костях и сосудах. Интересно, что гидроксипролин препятствует катаболизму пролина и стимулирует синтез белка различными сигнальными путями. Выведение гидроксипролина с мочой рассматривается одним из маркеров резорбции кости. К сожалению, данный показатель не является специфическим, так как отражает распад коллагена как скелетного,
так и не скелетного происхождения. Помимо участия гидроксипролина в обмене коллагена, он является субстратом для образования глицина, пирувата и глюкозы, то есть принимает участие в энергетическом обмене.