Треонин относится к незаменимым аминокислотам. Метаболизм треонина в организме может происходить по дегидратазному или дегидрогеназному путям. Особую роль в метаболизме треонина играет глюкагон. Под влиянием глюкагона происходит активация дегидратазного пути метаболизма треонина, наряду с увеличением внутриклеточного транспорта треонина. Р21-автивированная серин:треонин-киназа (РАК1) играет важную роль в клеточном цикле, повышает выживаемость, деление клеток, влияет на апоптоз клеток. Треонин играет важную роль в активации цитохрома Р450. Так, треонин входит в активный центр около 86% ферментов данного семейства. Известно, что семейство цитохром Р450 принимает участие в метаболизме жирных кислот, стероидных гормонов, эйкозаноидов, детоксикации лекарств, химических канцерогенов, поллютантов.